Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Smad9Q9JIW5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms