Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pus3Q9JI38 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pus3Q9JI38 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms