Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHW9

Aldh1a3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a3Q9JHW9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Aldh1a3Q9JHW9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms