Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tm9sf3Q9ET30 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tm9sf3Q9ET30 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms