Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim39Q9ESN2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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