Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms