Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
DysfQ9ESD7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DysfQ9ESD7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DysfQ9ESD7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DysfQ9ESD7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DysfQ9ESD7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DysfQ9ESD7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
DysfQ9ESD7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms