Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Usp29Q9ES63 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Usp29Q9ES63 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms