Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

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Length 703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slc28a3Q9ERH8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc28a3Q9ERH8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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