Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Dap3Q9ER88 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms