Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Capn12Q9ER56 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Capn12Q9ER56 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms