Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Vmn1r44Q9EQ47 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Vmn1r44Q9EQ47 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Vmn1r44Q9EQ47 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Vmn1r44Q9EQ47 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Vmn1r44Q9EQ47 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Vmn1r44Q9EQ47 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Vmn1r44Q9EQ47 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r44Q9EQ47 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r44Q9EQ47 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r44Q9EQ47 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r44Q9EQ47 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r44Q9EQ47 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r44Q9EQ47 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r44Q9EQ47 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r44Q9EQ47 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r44Q9EQ47 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r44Q9EQ47 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r44Q9EQ47 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r44Q9EQ47 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r44Q9EQ47 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r44Q9EQ47 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r44Q9EQ47 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r44Q9EQ47 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r44Q9EQ47 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r44Q9EQ47 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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