Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Cxcr6Q9EQ16 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Cxcr6Q9EQ16 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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