Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SgshQ9EQ08 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SgshQ9EQ08 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms