Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Ropn1lQ9EQ00 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms