Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SyncQ9EPM5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms