Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK8

Trpv4, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 4, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv4Q9EPK8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trpv4Q9EPK8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms