Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Mrpl4Q9DCU6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Mrpl4Q9DCU6 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms