Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Xab2Q9DCD2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Xab2Q9DCD2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms