Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Syde1Q9DBZ9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Syde1Q9DBZ9 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms