Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SrpraQ9DBG7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms