Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Smg9Q9DB90 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Smg9Q9DB90 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms