Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ccdc89Q9DA73 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc89Q9DA73 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms