Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA08

Sgf29, SAGA-associated factor 29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgf29Q9DA08 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sgf29Q9DA08 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sgf29Q9DA08 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms