Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf138rt1Q9D9M9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Rnf138rt1Q9D9M9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnf138rt1Q9D9M9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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