Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ifrd2Q9D8U0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms