Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fip1l1Q9D824 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms