Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cyp2c55Q9D816 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cyp2c55Q9D816 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms