Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slx4ipQ9D7Y9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms