Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn22Q9D7U6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn22Q9D7U6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms