Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Tmem54Q9D7S1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Tmem54Q9D7S1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tmem54Q9D7S1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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