Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ttc9bQ9D6E4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc9bQ9D6E4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms