Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt34Q9D646 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt34Q9D646 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt34Q9D646 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt34Q9D646 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt34Q9D646 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt34Q9D646 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt34Q9D646 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt34Q9D646 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt34Q9D646 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt34Q9D646 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt34Q9D646 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt34Q9D646 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt34Q9D646 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt34Q9D646 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt34Q9D646 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt34Q9D646 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt34Q9D646 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Krt34Q9D646 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Krt34Q9D646 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms