Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab11fip1Q9D620 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab11fip1Q9D620 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms