Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc7Q9D541 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ccdc7Q9D541 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms