Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam227bQ9D518 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms