Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc130Q9D516 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms