Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snx29Q9D3S3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snx29Q9D3S3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms