Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Vsig1Q9D2J4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vsig1Q9D2J4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms