Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pramef12Q9D2F1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pramef12Q9D2F1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms