Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Chordc1Q9D1P4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms