Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1lQ9D1E5 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1lQ9D1E5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1lQ9D1E5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1lQ9D1E5 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1lQ9D1E5 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1lQ9D1E5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1lQ9D1E5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1lQ9D1E5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1lQ9D1E5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1lQ9D1E5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1lQ9D1E5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1lQ9D1E5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1lQ9D1E5 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1lQ9D1E5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1lQ9D1E5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Lmbr1lQ9D1E5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Lmbr1lQ9D1E5 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms