Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Mrpl28Q9D1B9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Mrpl28Q9D1B9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Mrpl28Q9D1B9 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Mrpl28Q9D1B9 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Mrpl28Q9D1B9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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