Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lsm12Q9D0R8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms