Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N7

Chaf1b, Chromatin assembly factor 1 subunit B, mousemouse

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1bQ9D0N7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Chaf1bQ9D0N7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Chaf1bQ9D0N7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Chaf1bQ9D0N7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Chaf1bQ9D0N7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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