Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gtf2e1Q9D0D5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gtf2e1Q9D0D5 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms