Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Thumpd2Q9CZB3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Thumpd2Q9CZB3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms