Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snf8Q9CZ28 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snf8Q9CZ28 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms