Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gtpbp8Q9CY28 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gtpbp8Q9CY28 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms