Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Bud23Q9CY21 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Bud23Q9CY21 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Bud23Q9CY21 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Bud23Q9CY21 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Bud23Q9CY21 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Bud23Q9CY21 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Bud23Q9CY21 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Bud23Q9CY21 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Bud23Q9CY21 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Bud23Q9CY21 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Bud23Q9CY21 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Bud23Q9CY21 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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